可以想象，当那些第二次冲击的幸存者在得知真相后，会有多愤怒。
事实上，他们也的确非常愤怒。
seele的十五名高层，除了在被捕时自杀的那些之外，其他人全部上军事法庭，并且以“反人类罪”的名义判处死刑。与此同时，国联也正式将这部分信息昭告天下，同时开启了对seele组织成员的全面抓捕行动————方正早就利用《嗫告篇帜》把名单做好了，从上到下一个不落。
这个世界接下来该如何发展，还是要靠他们自己。
至于方正这边嘛……………
在失去了九架eva量产机后，伴随着seele的高层被逮捕，战自的作战也随即中止。这也算是让其他人都松了口气，毕竟他们可不想在这个地方和国家军队为敌。
但是这并不意味着没有秋后算账。
冬月耕造和赤木律子被逮捕了，他们是人类补完计划的实施者和帮手，国联自然不会放过这些人。nerv的设施被彻底封锁，所有工作人员都被强制解散。因为战自之前曾经在seele的蛊惑下对nerv发动袭击的行为，自然也是要付出代价。
于是在继旧东京之后，人畜无害小白兔作为国联的坚强后盾和帮助nerv没有被seele占领的功绩，得到了割让第三新东京市99年作为奖赏———嗯，这也算是方正和兔子之间心照不宣的秘密。
现在兔子这边已经开始了第三新东京市的重建工作，当然了，地下空间会被彻底填埋，nerv以及其他的一切也会被全部清理掉。这多少让nerv的工作人员有些不舍，不过………好歹没有上军事法庭，他们也算是心满意足了。
毕竟在得知seele居然就是引发第二次冲击的幕后黑手之后，nerv的大多数人同样被这个事实给雷的不轻。更不要说nerv居然还联合seele打算引发第三次冲击，毁灭人类？
妈耶，我们工作的地方居然这么危险的吗？
幸运的是，这些工作人员因为级别不高，因此大部分都被放过了，有些人选择了离开，有些人则选择留下，在这里重建第三新东京市。
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